Choć zabieg w komorze hiperbarycznej niesie mnóstwo korzyści dla zdrowia, trzeba pamiętać, że tak jak w przypadku wielu innych terapii, również i tu istnieją pewne przeciwwskazania. Należy do nich gorączka, ciąża, ale też padaczka, odma opłucnowa, nowotwory, przebyte operacje (np. w obrębie klatki piersiowej i uszu) czy rozedma płuc.
Terapia tlenowa jest dziedziną, która ciągle się rozwija i wciąż poznawane są jej nowe właściwości. W gąszczu chorób, których leczenie może wspierać, istnieje też szereg działań profilaktycznych, dlatego warto o terapii tlenem pomyśleć nawet będąc zdrowym po to, żeby to zdrowie i młodość zachować na jak najdłużej, oszczędzając sobie w przyszłości kosztownego i niezbyt przyjemnego leczenia wielu schorzeń.